Tematy prac magisterskich


dr Magdalena Mozolewska
  1. Zastosowanie algorytmów do analizy strukturalnej kompleksów białko-DNA.
  2. Analiza wpływu mutacji reszt aminokwasowych w białku na jego właściwości fizykochemiczne - użycie algorytmów.
  3. Analiza zależności sekwencji i struktury na funkcje białka na podstawie istniejących baz danych.
  4. Analiza baz danych genetycznych, sekwencyjnych i strukturalnych w celu zbadania wpływu konserwacji ewolucyjnej na struktury białek.
  5. Opracowanie narzędzia do przeprowadzania półautomatycznej analizy trajektorii dynamiki molekularnej.

dr Michał J. Dąbrowski
  1. Etnicznie specyficzne cechy układu odpornościowego ludzi – analizy statystyczne i maszynowe uczenie się na podstawie danych o ekspresji genów.
  2. Weryfikacja skuteczności algorytmów służących do wykrywania mutacji somatycznych – testowanie rozwiązania meta-serwera w celu podniesienia jakości predykcji.
  3. Testowanie niezależnych metod analitycznych w celu opracowania optymalnej metodyki do wykrywania sekwencji DNA regulujących procesem splicingu.
  4. Modelowanie stopnia złośliwości glejaka mózgu na podstawie danych molekularnych.

dr inż. Michał Dramiński
  1. Selekcja istotnych cech w danych o wysokim wymiarze i ciągłej zmiennej decyzyjnej przy użyciu metody Monte Carlo.
  2. Opracowanie algorytmu wyboru punktu odcięcia istotnego rankingu cech dla danych o wysokim wymiarze.
  3. Opracowanie algorytmu integrującego bazy danych w celu weryfikacji istnienia interakcji pomiędzy parami genów.